Io ho avuto lo stesso problema. cPanel non me la faceva inserire e quindi bisognava revocare la richiesta d’accreditamento e farne una nuova con il dominio/sottodominio messo come Common name nella CSR del server. Almeno così poi ho potuto installare il certificato tramite cPanel. Solo che neanche dopo questa operazione riesco a ricevere le notifiche da parte dell’SDI perché mi da sempre Fatal alert: protocol versione, vedi anche qui: Test Interoperabilità - TrasmissioneFatture risulta in javax.net.ssl.SSLException: Received fatal alert: protocol_version