Autofatture TD16 chiusura in PCC

In caso di gestione reverse charge interno con invio dell’autofattura TD16 allo SDI , il comune paga solo la fattura originaria ricevuta, abbiamo notato che l’autofattura resta aperta sulla PCC e concorre allo stock del debito , deve essere chiusa manualmente ? oppure nel mandato di poagamento potrebbero venire citate sia la fattura che l’autofattura ? , ma ha senso che le autofatture valgano ai fini dello stock del debito ?
Grazie