Traslitterazione vocale finale con segni diacritici

Come dovrebbe essere trasformata una vocale finale con segni diacritici diversa dalle poche elencate in http://www.prefettura.it/FILES/AllegatiPag/1241/decreto%20ministro%20pubblica%20amministrazione.pdf?

Inoltre, con la dicitura “Anagrafiche che terminano per una vocale accentata” si intende ogni componente del nome completo, quindi nome e cognome, o solo il cognome?

Con tali regole, ad esempio, non penso sia traslitterabile “José Mourinho”.

Penso sia: JOSE’ MOURINHO