Per quale motivo non dovrei poterlo fare? Ora non ricordo dove, ma ricordo che nel caso di personalizzazioni era stato suggerito e comunque è la modaità coretta di procedere, in modo da non perdere le modifiche durante i futuri update del tema
Ad esempio qui non viene certo sconsigliato: Creare un child theme
A sto punto cercherò di indagare un po’ per capire quale sia la soluzione migiore